[백준1969]파이썬-DNA

https://www.acmicpc.net/problem/1969

1969번: DNA

문제

DNA란 어떤 유전물질을 구성하는 분자이다. 이 DNA는 서로 다른 4가지의 뉴클레오티드로 이루어져 있다(Adenine, Thymine, Guanine, Cytosine). 우리는 어떤 DNA의 물질을 표현할 때, 이 DNA를 이루는 뉴클레오티드의 첫글자를 따서 표현한다. 만약에 Thymine-Adenine-Adenine-Cytosine-Thymine-Guanine-Cytosine-Cytosine-Guanine-Adenine-Thymine로 이루어진 DNA가 있다고 하면, “TAACTGCCGAT”로 표현할 수 있다. 그리고 Hamming Distance란 길이가 같은 두 DNA가 있을 때, 각 위치의 뉴클오티드 문자가 다른 것의 개수이다. 만약에 “AGCAT"와 ”GGAAT"는 첫 번째 글자와 세 번째 글자가 다르므로 Hamming Distance는 2이다.

우리가 할 일은 다음과 같다. N개의 길이 M인 DNA s1, s2, ..., sn가 주어져 있을 때 Hamming Distance의 합이 가장 작은 DNA s를 구하는 것이다. 즉, s와 s1의 Hamming Distance + s와 s2의 Hamming Distance + s와 s3의 Hamming Distance ... 의 합이 최소가 된다는 의미이다.

입력

첫 줄에 DNA의 수 N과 문자열의 길이 M이 주어진다. 그리고 둘째 줄부터 N+1번째 줄까지 N개의 DNA가 주어진다. N은 1,000보다 작거나 같은 자연수이고, M은 50보다 작거나 같은 자연수이다.

출력

첫째 줄에 Hamming Distance의 합이 가장 작은 DNA 를 출력하고, 둘째 줄에는 그 Hamming Distance의 합을 출력하시오. 그러한 DNA가 여러 개 있을 때에는 사전순으로 가장 앞서는 것을 출력한다.

풀이

입력받은 각 문자열에서 같은 자리에 있는 것 중 가장 많은 것을 정답에 넣고 그 답과 다른 문자의 갯수를 세는 것이다.

중복된 것이 있을 때 사전 순으로 놓는 것을 주의하자.

import sys
input=sys.stdin.readline
dna=[]
n,m=map(int,input().split())
for i in range(n):
    dna.append(input().strip())
ans=[]
HD=0
tmp1=['A','C','G','T']
for i in range(m):
    tmp=[0,0,0,0]
    for j in range(n):
        if dna[j][i]=='A':
            tmp[0]=tmp[0]+1
        if dna[j][i]=='T':
            tmp[3]=tmp[3]+1
        if dna[j][i]=='C':
            tmp[1]=tmp[1]+1
        if dna[j][i]=='G':
            tmp[2]=tmp[2]+1
    ans.append(tmp1[tmp.index(max(tmp))])
    for k in range(n):
        if tmp1[tmp.index(max(tmp))]!=dna[k][i]:
            HD=HD+1
for i in ans:
    print(i,end='')
print()
print(HD)